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由於受新冠肺炎影響，政府除已禁止中國大陸民眾入境台灣，也禁止旅行業組團前往中國大陸、香港、澳門旅遊或轉機。交通部更依衛福部要求，從2／10～4／29停止兩岸客運航線，僅留下往返「北京首都機場、上海浦東和虹橋機場、廈門高崎機場以及成都雙流機場」等四個城市、5條航線，是兩岸自2008年直航班機以來最嚴重的狀況，航空業、旅行業、觀光業者都受重創。
而根據交通部民航局統計，剩下的4個城市、5處機場，與原來的兩岸直航超過50個航點、每月超過1,345航班，航班量相比僅剩35%。
根據交通部航政司分析，以2月為例，兩岸定期航班有1,345架次，限縮航班後，將只有583架次，減少762架次；而3月、4月因應限縮措施，兩岸航班減少架次會更多。
目前國籍航空包括華航、長榮、華信、立榮、星宇和台灣虎航等均取消兩岸航班以及澳門航班，合計已超過超過千班。
另外，2／10起，陸委會也發布暫時關閉小三通客船通航，包括華信航空、立榮航空都表示，已暫停兩岸快易通以及金廈一條龍服務，並提供小三通套券旅客退票免手續費之服務，旅客可撥打客服專線、機場辦事處或聯繫購票旅行社退票。
民航局通知各航空公司，配合防疫需求，限縮兩岸航班措施，妥善處理旅客退票，不收手續費。影響產業的部分，交通部長林佳龍表示已批准部分紓困方案經費；由於兩岸取消出團，估計相關業者合計損失約20億元，因此，已批准近20億元救急金，以彌補代墊款損失。
【TTN旅報1130/1131期, 2020/2/24 出刊, P25】
